Στο Τμήμα Ποιμαντικής και Κοινωνικής Θεολογίας λειτουργεί από το ακαδ. έτος 2018-2019 το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Σπουδές στην Ιστορία, την Πνευματικότητα, την Τέχνη και τη Μουσική Παράδοση του Αγίου Όρους», το οποίο έχει ως αντικείμενο την επιστημονική κατάρτιση και εξιδείκευση πτυχιούχων.